在中，清洁镜头与滤光片方面，不要让让灰尘、指纹等留在金相显微镜的镜头与滤光片上。镜头、滤光片上留下污垢将影响图像的观察效果。如果任何镜头变脏，用软刷刷掉灰尘，或用纱布将其拭净。只有出现指纹或油脂时，才用*（乙荃或甲醇等）蘸湿清洁且柔软的棉布、镜头纸或纱布，然后进行擦拭。*高度易燃，因此使用时应小心。在附近用火或开启／关闭电源开关时请小心。金相显微镜清洁涂装、塑料与印制部件。请勿在涂装、塑料或印制部件上使用有机溶剂（酒精、乙醚、油漆稀释剂等）。否则会造成印制的字符掉色或脱落。如果污垢难以去除，则请使用经中性清洁剂蘸湿的纱布轻轻擦拭。（在无尘室中则使用无尘室擦拭布取代纱布。）
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