夫妻分居债务的处理方式是对债务的性质进行认定后，对属于个人债务的由个人财产进行偿还，属于夫妻共同债务的由夫妻双方共同偿还，双方可以协商具体清偿办法。
一、夫妻分居债务如何处理
夫妻分居债务处理需要对债务性质进行认定，个人债务应由夫或妻一方以个人财产偿还，如果是夫妻共同债务则由夫妻双方共同偿还，一般是协商解决，协商解决不了的由法院判决。
《中华人民共和国民法典》 第一千零六十五条 男女双方可以约定婚姻关系存续期间所得的财产以及婚前财产归各自所有、共同所有或者部分各自所有、部分共同所有。约定应当采用书面形式。没有约定或者约定不明确的，适用本法第一千零六十二条、第一千零六十三条的规定。
夫妻对婚姻关系存续期间所得的财产以及婚前财产的约定，对双方具有法律约束力。
二、夫妻分居多久可以自动离婚
不管夫妻分居多久，都不会自动离婚的。我国不存在自动离婚的情形，离婚毕竟需要法定程序，须双方去民政局协议离婚，或者法院判决离婚，有些夫妻常常认为分居两年可以自动离婚，这是因为他们误解了婚姻法规定的因感情不和分居满两年的可以认定夫妻感情确已破裂这条规定。因感情不和分居2年以上是可以起诉离婚的，夫妻双方不能协商一致，是可以去法院起诉离婚，由法院裁决是否准予离婚，目前法律上没有说明自动离婚的情况。
三、夫妻分居离婚需要什么证据
1.一方在外居住的房屋租赁合同；
2.双方签订的夫妻分居书面协议，一定是要书面的，口头协议必须对方承认；
3.双方来往的书信、电子邮件等能证明双方感情不和分居的事实。
法律依据：《中华人民共和国民法典》
第一千零七十六条 夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。
第一千零七十九条 夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。