中文名称：水溶性五甲川花菁染料标记羧基
英文名称：sulfo-cyanine5 carboxylic acid
简称：sulfo-cy5 cooh
cas：1144107-82-3
外观/appearance：绿色粉末/dark green powder
分子式/molecular formula：c32h37n2ko8s2
分子量/molecular weight：680,87
cy系列荧光染料常见的有：非磺化cy染料和磺化cy染料（sulfo-cy）。这两类染料有相同的骨架结构，所以它们具有几乎一样的荧光谱图和荧光灵敏度，在大多数情况下可以交换使用。仅有的不同是磺化cy染料在其发色团上各有两个硫酸离子官能团，所以这类染料具有非常好的水溶性。在对样品水溶性（比如被标记物水溶性差希望标记后分子水溶性好）或者被标记生物分子稳定性（比如一些蛋白分子）要求较高时，磺化cy染料是更好的选择。
磺化cy5是cy5(cyanine 5)的水溶型。它的光谱性质和cy5类似，在荧光显微镜下发远红色荧光。它荧光亮，对ph不敏感，一般可以用633 nm或647 nm的激光束激发然后用 cy5或apc滤片观察，所以在绝大部分荧光仪器上都可以使用。
磺化cy5荧光落在远红光区，使用磺化cy5或者其它远红光染料的一个重要优势是在这个长波长光谱范围内样品背景荧光较低，而在这个区域ccd相机/检测器检测灵敏度高。
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