cd46为一单链跨膜糖蛋白，其染色体定位于人类1号染色体短臂的32号区，分子量为45-70kda，又命名为gp45-70，属于补体活化调节蛋白因子家族。cd46的n端由四个补体控制蛋白（ccp）组成，后面是通过选择性剪接产生的o-高度糖基化区域，并包含b和/或c异构体。b和c结构域富含氨基酸丝氨酸、苏氨酸和脯氨酸（stp），并通过功能未知的12个氨基酸区域与跨膜结构域相连。
cd46的细胞内区域由两种氨基数目不同的短尾(cyt1包含16个氨基，cyt2含有23个氨基)组成。选择性剪接可产生带有cyt-1的同工型或带有cyt-2的同工型，它们都含有信号传导基序，并且在炎症环境中差异表达
人cd46也称为膜辅因子蛋白（mcp），属于补体激活调节剂（rca）蛋白质家族。除了cd46，rca家族还包括衰变加速因子（cd55 / daf）、补体受体1（cr1 / cd35）和2（cr2 / cd21）、c4结合蛋白和h因子（fh）。如figure2所示，cd46作为膜辅因子介导的c3b和c4b裂解辅助因子，是先天免疫系统中经典和选择性补体激活级联反应的关键调节因子[6]。裂解多余的c3b可以产生膜结合的c3bi和可溶性c3f。c4b的裂解可以产生膜结合c4d和可溶性c4c。