气相色谱柱是气相色谱仪的核心部件之一。色谱柱常见的柱参数有：柱长、内径、膜厚、固定相。
1、柱长：
10～15m通常十个组分以下简单样品的快速分析；
25～30m标准柱长满足绝大部分应用；
50m，60m，100m复杂样品的分析。
2、内径：
0.53mm大口径可替代填充柱能承受较大体积进样，痕量分析；
0.32mm宽径，分流/不分流进样，能承受较大体积进样；
0.25mm窄径分流进样，gc/ms应用，较高柱效；
0.18mm微径较快分离高柱效；
0.10mm快速gc，快速分离对仪器要求高。
3、膜厚：
0.10um薄膜，保留和柱容量低适用于高沸点化合物、组分密集样品或热敏化合物0.25~0.50um标准膜厚应用广泛；
1.0~10.0um厚膜保留和柱容量高，适用于低沸点挥发性化合物；
厚膜有利于掩蔽活性位点但高温下柱流失较大。
4、固定相
当面对一个未知物时，先试用现有gc柱，如果该柱分离不理想，基本原则是分析物与固定相有相似化学性质时才会相互作用。这说明需要对样品十分了解，就容易找到合适的固定相。
非极性分子——通常仅由c和h组成并且无偶极矩，直联（正烷）是常见的非极性化合物的例子。
极性分子——主要由c和h组成同时也有其他原子，如:n、o、p、s或卤素。样品包括有醇类、胺类、硫醇类、酮类、有机卤化物等。
可极化物质——主要由c和h组成同时包含不饱和键。通常有:炔和芳香族化合物。如果样品是具有相似的化学性质的非极性组分的混合物，比如大多数石油馏分中的烃，可以试用按沸点顺序分离的毛细管色谱柱。如果有芳族化合物，可试用有苯基的。
极性或可极化组分样品能够在中极性和/或可极化固定相色谱柱上进行分析，如有苯基或类似基团固定相。如需要更高极性的，可以选用聚乙二醇（peg）固定相。