怀孕期间男人出轨了是可以协商离婚的，或者起诉离婚，法院会对此进行调解，确定婚姻关系破裂的，会判决离婚。怀孕期间离婚孩子由女方抚养，如果在特殊情形下是由男方抚养。
一、怀孕期间男人出轨了怎么办
怀孕期间男人出轨了可以协议离婚，或者由女方向法院提出离婚申请。
法律规定，女方在怀孕期间，男方不得提出离婚，如果由女方提出离婚的，法院是会受理的。对于男方出轨的行为，法院经过调解，夫妻感情确已破裂的，应当准予离婚。
根据《民法典》第一千零八十二条的规定，女方在怀孕期间、分娩后一年内或者终止妊娠后六个月内，男方不得提出离婚；但是，女方提出离婚或者人民法院认为确有必要受理男方离婚请求的除外。
二、怀孕期间离婚孩子由谁抚养
怀孕期间离婚孩子原则上是由女方抚养的。但有特殊情况的除外。根据法律规定，不满两周岁的子女离婚一般由女方抚养。女方不愿抚养或者患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活的等，由男方抚养。
《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条
父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。
离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。
离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。
三、怀孕期间离婚协议书怎么写
1.写明夫妻的姓名、职业等基本情况信息；
2.写明双方协议离婚的事实和理由；
3.写明双方自愿离婚的意思表示、财产以及债务处理及子女出生后抚养权分配等事项协商一致的意见。
《民法典》第一千零七十六条夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。
第一千零七十七条自婚姻登记机关收到离婚登记申请之日起三十日内，任何一方不愿意离婚的，可以向婚姻登记机关撤回离婚登记申请。
前款规定期限届满后三十日内，双方应当亲自到婚姻登记机关申请发给离婚证；未申请的，视为撤回离婚登记申请。