近日，一项新的研究结果，为新型基因编辑，基因检测技术以及药物研发提供了重要理论支撑。基因编辑技术，需要对遗传物质进行精准的操控，因此需要严格控制实验环境中的核酸污染。德国mb公司生产的核酸污染祛除试剂——pcr clean，即用型喷雾，可直接喷洒在待清洁物品表面，高效清除核酸污染。
argonaute (ago)介导rna或dna引导的核酸抑制。虽然真核生物(eagos)和长原核生物ago (pagos)蛋白的机制是已知的，但短pagos的机制仍然是难以捉摸的。
近日，科研人员确定了来自crenotalea thermophila (crt)的短pago和相关的tir- apaz蛋白(sparta)的低温电镜结构:一个自由状态的rt-sparta (3.27 å)，一个装载引导rna /靶dna的rt-sparta (3.27 å)，两个具有不同tir组织的rt-sparta二聚体(3.49 å和3.50 å)，以及一个rt-sparta四聚体(3.41 å)。
相关研究发表在《nature》上，文章标题为：“nucleic acid-triggered nadase activation of a short prokaryotic argonaute”。
该项研究中的结构，揭示了ct - sparta是由连接tir叶的双叶折叠ago叶组成的。rt- ago含有mid和piwi结构域，而rt-tir- apaz含有tir、n-like、linker和trigger结构域。结合的rna/dna双链采用b型构象，可被碱基特异性接触识别。核酸结合导致构象变化，因为触发器作为一个障碍，阻止引导rna 5 ' -和目标dna 3 ' -末端到达它们的规范口袋，这扰乱了mid结构域并促进了rt- sparta二聚化。两个rna/ dna负载的rt- sparta二聚体通过它们的tir结构域形成一个四聚体。四个crt-tir组装成两个平行的，头尾相连的tir组织，表明nadase活性构象。
该项研究结果揭示了短pagos防御入侵核酸的结构基础，并为优化基于sparta的可编程dna序列检测提供了见解。