中药废水的水质特点是含有糖类、苷类、有机色素类、蒽醌、鞣质体、生物碱、纤维素、木质素等多种有机物；废水ss高，含泥沙和药渣多，还含有大量的漂浮物； cod浓度变化大，一般在2 000～6000mg/l之间，甚至在100～11000 mg/l之间变化；色度高，在500倍左右；水温25～60℃。
化学制药废水的水质特点是废水组成复杂，除含有抗生素残留物、抗生素生产中间体、未反应的原料外，还含有少量合成过程中使用的有机溶剂。cod浓度大，一般在4000～10000mg/l之间。每吨抗生素平均耗水量在万吨以上，但90%以上是冷却用水，真正在生产工艺中不可避免产生的污染废水仅占5%左右，这部分工艺废水都罐水，洗塔水，树脂再生液及洗涤水，地面冲洗水等，排放严重超标，主要是cod、bod，其他还有氮、硫、磷、酸、碱、盐。每吨抗生素产生的高浓度有机废水，平均为150～200m3，发酵单位低的品种，其废水量成倍增加，这种废水的cod含量平均为15000mg/l左右，抗生素行业废水排放量约为350万m3左右，造成水环境的严重污染。
生物制药厂大多有冷却水排放。一般污染段浓度不大，可直接排放，但回用。有些药厂还有酸、碱废水，经简单中和可达标排放。在生物制药废水中，*生产废水有机污染也十分严重，综合废水的cod含量可达为8000～10000 mg/l，含甲醇、乙醇、甲酸、蛋白质、古龙酸、磷酸盐等物质，废水偏酸性。
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