早期用于lps化学结构研究的lps主要来源于正常肠道菌群或引起胃肠道疾病的革兰阴性细菌，开始于20世纪60年代。在lps化学结构的研究中，otto luderitz起到了开拓性的作用，他率-先明确提出lps由三部分组成：即о特异性侧链（o-specific sidechain）、基础核心（basal core）和脂质a（lipid a）。
o特异性侧链由几个完-全相同的寡糖组成，曾被称为重复单位（repeating units）。细菌间о特异链的结构有着明显差异，其抗血清对相应细菌有很强的特异性，一般不与其他细菌反应。基于这种认识，fritz kauffmann建立了鉴定沙门菌血清型（serotypes）的方法。根据该方法，可将细菌分为不同的血清分型。о特异性链的差异也使相应的lps具有独-特的特性，kauffmann、luderritz和westphal将此特性称为lps的化学表型（chemotypes）。
1975年，stead发现，一些革兰阴性细菌无о特异链。这些细菌的血清特异性是由lps糖基化区的末端糖决定的。因为这些细菌lps具有相对短的糖基链，schneider（1984）将这种lps称为脂寡糖（lipooligo-saccharide，los）。
核心寡糖（core oligosaccharide）是lps的另一个结构部分。1967年，luderitz和westphal等首-次提出了核心结构，认为核心由靠近о链的外核和靠lipid a的内核组成。用于核心寡糖的结构特征研究的最-好-的实验对象是肠道杆菌的rough突变株。rough突变株表现为不规则和粗糙的菌落形态，具有独-特的血清学特征（与о抗原抗血清无反应）。其lps为r型lps，所有r型lps均缺乏о特异链。1969年，west-phal和luderitz进一步建立了提取r型lps的方法，即酚-氯仿-石油（phenol-chloro-form-petroleum）法。
虽然，脂质a（lipid a）早就被认为是lps的毒性中心，但是，该观点在很长时间内并未被广泛接受。对其结构的认识较为困难，因而明显晚于对о链和核心部分的认识。
miles和pirie可能是最先认识到脂质成分的科学家。早在1939年，他们利用矿物酸处理马耳他布鲁杆菌lps时，发现了一种类似脂质的沉淀物。当时，miles和pirie并没有将这种物质称为lps，而被称为天然抗原（native antigen）。最早提出脂质a名称的是westphal和luderitz。1954年，科学家利用矿物酸处理未降解的多糖，获得了一种不溶于二-乙-醚和石油醚，但易溶于氯仿和吡啶的物质，为了区分另一种甲酰胺提取的脂质成分，前者被称为脂质a，后者被称为脂质b。脂质b后来被证明是磷脂酰乙醇胺。后来的研究证实，用酸处理lps可使2-酮-3脱氧辛酸（kdo）与脂质a间连接发生断裂，产生脂质a沉淀物。
1958年，美国carl niemann在研究大肠杆菌lps时提出了脂质a的化学结构：d-g1cn，磷，和（r）-3-羟十四烷酸。westphal和luderitz也发现沙门菌脂质a含有同样成分。1969年，jobstgmeiner分析sminnesota re突变株lps，首-次显示脂质a含有一个d-g1cn二糖，二者β（1~6）互联，在1'和4'位点上携带磷残基。随后在肠道杆菌和非肠道杆菌的lps的脂质a均发现了同样的结构。1983年，阐明了大肠杆菌脂质a完整的共价结构，分子量为1798。1990年，chris rh raetz通过生物合成脂质a进一步证实了脂质a的结构。