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茶树est资源中ssr的信息分析

从ncbi公共数据库下载获得1989条茶树est,去除其中的低质量的和冗余的序列,得到全长为734.54kb的1589条无冗余est。共在这些序列中发掘出了281个est.ssr,分布于246条est中,出现频率是17.68%。这些est-ssr的平均长度为33.06bp,平均分布频率是1/2.61 kb。茶树est-ssr中,二核苷酸重复是主要的重复类型,出现最多的重复基元类型是ag/ct重复。本研究为茶树est-ssr标记的建立和进一步应用奠定了基础。完成机构:[1]浙江大学原子核农业科学研究所,杭州310029 [2]中国计量学院生命科学学院,杭州310018
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