您好,欢迎访问一九零五行业门户网

荧光分光光度计 测量寡核苷酸的熔解温度

简介
在生物化学领域中,生物材料的热学性能研究是材料分析的重要组成部分。而熔解温度(tm)是生物材料中应用zui广泛的热学性能。生物材料由许多化学键组成,随着温度的升高,材料内能增加同时化学键断裂。这种因化学键断裂而导致生物材料结构改变的现象被称作热变性。此外,zui活跃时的变性温度被称为熔解温度。熔解温度是用于表征材料稳定性的指标之一。寡核苷酸是一种遗传物质,由多组碱基构成。寡核苷酸可以很容易地和它们的互补对链接,所以常用来作为探针确定dna或rna的结构,经常用于基因芯片、电泳、荧光杂交等过程中。如图1所示,我们将alexa fluor®488荧光探针标记在寡核苷酸的5´端部,将alexa fluor®532荧光探针连接在另一端。
本实验采用thermo fisher公司的lumina荧光分光光度计配备 peltier温控系统(图2)对不同温度下的荧光性能进行了测量。peltier温控系统可快速地对温度进行调节,温度范围可控制在-10℃到100℃。该系统有样品除霜功能、磁力搅拌功能和温控功能。本研究采用 lumina和 peltier系统,结合荧光标记,研究了寡核苷酸荧光强度与温度的关系。zui终根据一阶导数分析熔点曲线并计算出了tm值。
图 2:peltier系统配件(单池池架(a)、4联池池架(b)、peltier控制模块(c))
试剂和仪器
1.lumina荧光分光光度计
2.peltier 控制模块、单池池架
3.供体寡核苷酸5´ – (alexa 488) – accgtgagca – 3´
4.受体寡核苷酸
5´ – (alexa 532) – tgctcacggt – 3´ 5.tris-edta 缓冲液(ph 8.0)
6.nacl(acs 试剂,≥99.0%)
7.10ml 塑料管
8.荧光比色皿
实验步骤
1.添加10ml 的tris-edta 缓冲液(ph 8.0)到两根塑料管中,形成浓度分别为172mm(供体)190mm(受体)的nacl溶液。
2.在上述缓冲液中溶解供体/受体寡核苷酸,使浓度变为900nm。
3.混合已制备的供体试剂和受体试剂,然后在室温下培养5分钟。
4.将peltier系统安装在lumina上。5.打开luminous的thermal软件,如图3输入预定参数。使用软件(excel®, origin®等)根据供体各测量点数据计算一阶导数,并在测量后查看tm值。
仪器参数
图3:thermal软件测量条件
实验结果
fret 现象是供体到受体的一种能量转移现象,这是由于荧光物质受热前荧光探针间距离较短造成的。因
此,在供体激发波长519nm处发出较弱的荧光,在受体的激发波长553nm处发出较强的荧光。另一方面,
随着受热产生的热变性现象,与fret现象相反。换句话说,荧光在519nm时较强,而在553nm时较弱(图4)。
图4:受热前(左图,25℃)、受热后(右图,55℃)热变性荧光强度如图5所示,我们绘制了供体、受体荧光强度与温度的关系。可以确认,供体和受体上发生的荧光强度逆转的情况是由于 fret现象消失导致的。
图5:供体、受体荧光强度与温度的关系
目前有多种方法可以确定tm值,本实验中我们通过一阶导数的峰值来确定tm值。本次试验所用寡核苷酸的tm值为49℃。(图6)
图6:荧光强度随温度而改变
实验结论
本研究中,使用thermo fisher公司lumina荧光分光光度计和peltier温控系统,研究了温度变化对寡核苷酸荧光强度的影响。此外,根据实验数据计算出代表材料安全性的tm值。
其它类似信息

推荐信息