制药工业废水通常属于较难处理的高浓度有机废水之一，通常具有成分复杂，有机污染物种类多、浓度高。cod值和bod，值高且波动性大，废水的bod5/cod值差异较大，nh3-n浓度高，色度深，毒性大，固体悬浮物ss浓度高等特点。目前，制药工业废水常用的处理方法大多为：物化法、生物法、物化法一生物法联用等处理工艺。
1物化处理技术：物化法是通过物理和化学的综合作用使废水得到净化，例如混凝、反渗透、吹脱、气浮和吸附等。它们不仅可作为制药工业废水的单独处理工序，为生物处理工序的预处理或后处理工序。
1.1混凝法：对于像*等抗生素废水，从发酵工艺过程知道，cod和toc的绝大部分是培养基成分，这些成分主要以胶体形态存在，加入*等混凝剂后，可以使体系中存在三价铁，从而改善絮体的沉降性能，激活废水中降解微生物某些酶的活性。
　1.2气浮法：气浮法通常包括充气气浮、溶气气浮、化学气浮和电解气浮等多种形式。化学气浮适用于悬浮物含量较高的废水的预处理，具有投资少、能耗低、工艺简单、维修方便等优点，但不能有效地去除废水中可溶性有机物，尚需其他方法作进一步的处理。在制药工业废水处理中，如*、*、*等废水的处理，常采用化学气浮法。
　吸附法：吸附法是利用多孔性固体吸附废水中某种或几种污染物，以回收或去除污染物，达到净化废水的目的。常用的吸附剂有油粉末活性炭、煤质柱状活性炭、人造沸石、炉渣、膨润土、高岭土、硅藻土等。在制药废水处理中，常用煤灰或活性炭吸附预处理生产中成药、米菲司酮、洁霉素、*等生产废水。