气相色谱仪色谱法的zui大长处在于它能别离剖析多组分的杂乱体系，这是光谱、质谱所不及的。并且一般说来，色谱法的灵敏度也要比光谱高。可是色谱法也有它的缺点，即在缺少纯样品的情况下定性比较困难。与色谱法不同，用质谱法可测定未知物的分子量，用光谱法可测定分子中含有那些官能团，这些都是气相色谱法所不及的。所以色语和光诺、质谱联用，常常能够发挥更大的效果。
色谱别离所得纯物质的纯度比常用精细分馏高得多。但处理量小。作为工业规模的别离手法，色谱法还只能算处于发展阶段，而精细分馏已在工业上广泛应用。
气相色谱仪色谱进程的抱负条件是:
(1)组分在液相和气相之间的分配是瞬时完成的。
(2)液相和气相的比率在整个柱子中是稳定的。
(3)载气流速保持稳定不变。
(4)组分分子在经过柱子时，不论在气相或在液相中都不发作纵向分散。