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变性琼脂糖凝胶电泳测定过程

实时荧光定量pcr (quantitative real-time pcr)是一种在dna扩增反应中,以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应(pcr)循环后产物总量的方法。通过内参或者外参法对待测样品中的特定dna序列进行定量分析的方法。 变性琼脂糖凝胶电泳测定过程:
1、制胶
1 g琼脂糖溶于72 ml水中,冷却至60℃,10 ml的10 x mops电泳缓冲液和18 ml的37% jia醛溶液(12.3 m)。
10x mops电泳缓冲液
浓度 成分
0.4 m mops,ph 7.0
0.1 m 乙酸钠
0.01 m edta
灌制凝胶板,预留加样孔至少可以加入25 μl溶液。胶凝后取下梳子,将凝胶板放入电泳槽内,加足量的1xmops电泳缓冲液至覆盖胶面几个毫米。
2、准备rna样品
取3 ugrna,加3倍体积的甲醛上样染液,加eb于甲醛上样染液中至终浓度为10 ug/ml。加热至70℃孵育15分钟使样品变性。
3、电泳
上样前凝胶须预电泳5 min,随后将样品加入上样孔。5-6 v/cm电压下2 h,电泳至溴酚兰指示剂进胶至少2-3 cm。
4、紫外透射光下观察并拍照
28s和18s核糖体rna的带非常亮而浓(其大小决定于用于抽提rna的物种类型),上面一条带的密度大约是下面一条带的2倍。还有可能观察到一个更小稍微扩散的带,它由低分子量的rna(trna和5s核糖体rna)组成。在18s和28s核糖体带之间可以看到一片弥散的eb染色物质,可能是由mrna和其它异型rna组成。rna制备过程中如果出现dna污染,将会在28s核糖体rna带的上面出现,即更高分子量的弥散迁移物质或者带,rna的降解表现为核糖体rna带的弥散。用数码照相机拍下电泳结果。
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