化妆品生产废水的一级处理常采用筛滤法，可以采用金属筛网，以截阻水中固体物质，对于化妆品生产废水更宜采用格栅，以防废水中的大块漂浮物阻塞构筑物的孔洞、闸门和管路，或损坏水泵等机械设备。由于化妆品生产多为间歇操作，不同时段水质变化较大，采用调节池以均化水质是必须的，可减少后续处理的冲击负荷。化妆品生产废水的二级处理普遍利用好氧微生物的生命活动过程，将有机污染物氧化分解成稳定的无机物。这一过程也称为好氧生物处理，可以是活性污泥法，也可以是生物膜法。据报导，采用两级接触氧化，cod去除率达70%和60%;华南某日用化工厂采用三级生物接触氧化，cod、bod5、ss的去除率分别达97.6%，97.9%和87.4%。
采用单一的处理技术治理化妆品生产废水往往难以取得理想的效果，组合处理已成为生产企业的共识。各企业生产品种不同、产量不同，因此水质各不一致。一种废水往往可用几种组合工艺进行处理，采用哪一种方法需要进行多方案的技术经济比较，以确定一个适合自己的，技术可行又经济合理的废水处理方案。