杀菌锅能够快捷有效的产品上所存在细菌进行杀菌操作。在选择杀菌锅设备的时候，首先应该从杀菌锅设备的杀菌效果上进行选择，这是因为良好的杀菌效果能够对产品的性能等都会产生影响。
杀菌锅设备在进行杀菌时，其所使用的杀菌介质不同会导致设备内部的温度分布的不够均匀，从而会对产品的杀菌效果产生一定的影响。当产品需要拥有较为严格的杀菌温度时，这可以使用采用热水循环杀菌以及淋水式杀菌的杀菌锅设备。
当使用双层杀菌锅对产品进行杀菌操作时，其能够将杀菌结束后的热水进行储存，从而有效的降低二次杀菌时所需要的加热消耗。但其不能对罐装的产品进行杀菌，这是因为罐装的产品不能够较快的进行升温以及降温。
杀菌锅还拥有手动、半自动以及全自动的操作方式，其能够对不同的产品采用不同操作方式，从而可以使得杀菌锅能够满足大多数产品的杀菌需求。