点击化学是一种多功能反应,可用于合成各种缀合物。事实上,任何生物分子都可以使用点击化学方法轻松地用小分子标记,例如荧光染料、生物素等。
点击化学反应发生在两种组分之间:叠氮化物和炔烃(末端乙炔)。叠氮基和炔基在天然生物分子中几乎从未遇到过。因此,该反应具有高度生物正交性和特异性。如果需要标记寡核苷酸,可以在许多定制寡核苷酸合成设施和公司订购炔烃修饰的寡核苷酸。
使用下表计算点击化学标记所需的试剂体积。准备所需的储备溶液(见附录)。
试剂混合物中的最终浓度原液浓度
炔烃修饰寡核苷酸 变化(20 — 200 um) 各不相同
叠氮化物 1.5 x(寡核苷酸浓度) 10 mm dmso 溶液
二甲基亚砜 50体积% —
抗坏血酸 0.5毫米 5 mm 水中
铜-tbta络合物 0.5毫米 10 mm,溶于 55 vol% dmso
将炔烃修饰的寡核苷酸或 dna溶解在耐压小瓶中的水中。
添加2m 醋酸三乙铵缓冲液(ph 7.0)至终浓度 0.2 m。
添加dmso,并涡旋。
添加叠氮化物储备溶液(dmso 中的 10 mm),并涡旋。
将所需体积的5mm 抗坏血酸储备溶液添加到混合物中,并短暂涡旋。
通过向其中鼓泡惰性气体 30 秒来对溶液进行脱气。可以使用氮气、氩气或氦气。
将所需量的10 mm 铜 (ii)-tbta 库存在 55% dmso 中添加到混合物中。用惰性气体冲洗小瓶并盖上盖子。
涡旋混合物。如果观察到明显的叠氮化物沉淀,则将小瓶在 80°c 下加热 3 分钟,然后涡旋。
在室温下保存过夜。
用丙酮(对于寡核苷酸)或乙醇(对于 dna)沉淀结合物。
沉淀寡核苷酸缀合物:
向混合物中添加至少 4 倍过量体积的 3% 高氯酸锂丙酮溶液(如果混合物体积很大,则分成几个小瓶)。
沉淀 dna 缀合物:
向混合物中添加乙酸钠至终浓度0.3m;
添加 2.5 体积的乙醇(或 0.8 体积的异丙醇)。
充分混合并在-20°c下保持20分钟。
10000 rpm 离心 10 分钟。
丢弃上清液。
用丙酮 (1 ml) 洗涤沉淀,以 10000 rpm 离心 10 分钟。
弃去上清液,干燥沉淀,并通过 rp-hplc 或 page 纯化缀合物。