gps时钟系统对时方式主要有以下几种：
1、脉冲同步信号(硬对时)：时钟装置的同步脉冲以空接点、ttl电平、422电平(差分)、24v/110v/220v有源、电流环方式输出。
2、时间报文(软对时)：被对时设备通过串行口读取同步时钟每秒一次的串行输出的时间信息对时。串行口信息包括年、月、日、时、分、秒，也可包含用户的其它特殊内容，如接收gps卫星数、告警信号等。
3、irig-b：一种应用于靶场的串行时间交换码。由美国靶场司令部委员会下属靶场仪器组提出的一种时间信息编码标准，现应用较为广泛。
4、ntp协议:network time protocol(ntp)是用来使计算机时间同步化的一种协议，它可以使计算机对其服务器或时钟源(如石英钟，gps等等)做同步化，它可以提供高度的时间校正(lan上与标准间差小于1毫秒，wan上几十毫秒)。sntp协议:sntp是简单网络时间协议(simple network time protocol)的简称，它是目前internet网上实现时间同步的一种重要工程化方法。sntp协议采用客户/服务器工作方式，服务器通过接收gps信号或自带的原子钟作为系统的时间基准，客户机通过定期访问服务器提供的时间服务获得准确的时间信息，并调整自己的系统时钟，网络时间同步的目的。客户和服务器通讯采用udp协议，端口为123。
5、dcf77信号(deutsche,long wave signal,frankfurt,77.5khz)：德国校准讯号(简称dcf77)：由physikalisch-technische bundesanstalt(ptb)运营，从法兰克福的东南部发射。载波频率为77.5千赫，时间信息编码采用脉宽调制方式。
以上gps时钟系统对时方式介绍。