pcr是聚合酶链式反应（polymerase chain reaction）的简称，是一种体外扩增特定dna片段的分子生物学技术。pcr的常见种类分述如下：
1、普通pcr
普通pcr即一代pcr，使用普通pcr扩增仪扩增靶基因，并通过琼脂糖凝胶电泳对产物进行定性分析。
2、实时荧光定量pcr（quantitative real-time pcr, qpcr）
实时荧光定量pcr，也叫real-time pcr，即二代pcr，是指在pcr扩增反应体系中加入荧光染料或者荧光基团，在整个pcr过程中通过收集荧光信号实时监测每一个循环中扩增产物量的变化，最后通过标准曲线和ct值对待测样品进行定量分析。qpcr常用的有两种方法：sybr green法和taqman探针法。
①荧光染料法（sybr green）：sybr green ⅰ是荧光定量pcr中zui常用的荧光染料，它能与所有的双链dna结合。在pcr反应体系中，加入sybr green ⅰ，它就会在过程中与双链dna结合，从而产生荧光信号。因此，反应中发出的全部荧光信号就会与反应中双链dna的量呈正比，荧光强度也会随着产物的增加而增加。但是由于染料与双链dna是非特异性结合，因此可能产生假阳性的结果。
优点：价格相对较低；使用方便；对dna模板没有选择，通用性好；检测灵敏度高。
缺点：可能产生假阳性结果，需要通过熔解曲线分析识别扩增产物的特异性；需要不断优化反应体系以降低非特异性扩增；不适合进行多重qpcr检测。
②荧光探针法（taqman技术）：taqman探针是最早用于定量的方法，也是临床检测中zui常用的检测方法。pcr扩增时，加入一对引物的同时再加入一个特异性的荧光探针。该探针是一个寡核苷酸，5'端标记一个荧光报告基团（reporter, r），3'端标记一个淬灭基团（quencher, q）。当探针完整时，报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收，以至于无法检测到荧光信号；而当pcr扩增时（在延伸阶段），探针会被taq酶的5'→3'外切酶活性酶切降解，使报告基团和淬灭基团分离，报告基团发射底的荧光不会再被吸收，从而可以在荧光监测系统接收到荧光信号，即每扩增一条dna，就形成一个荧光分子，pcr产物的形成与荧光分子的形成wan全同步，pcr产物越多，荧光信号累积的越多，荧光强度越大。
优点：检测特异性强；灵敏度高；适合进行多重qpcr检测；pcr后续无需处理，节省时间和原料成本。
缺点：需要根据不同的序列，合成不同的探针；探针的水解依赖taq酶外切酶的活性，定量时容易受试剂和酶性能影响；淬灭难以完，本底较高；检测结果很难判断实际的扩增特性。
注：多重pcr，也称多重引物pcr或复合pcr，是在一个反应体系中加入两对以上引物，同时扩增出多个核酸片段
的一种新型pcr扩增技术。
3、数字pcr（digital pcr, dig-pcr, dpcr）
数字pcr即三代pcr，是对原始pcr的另一种改进，是一种能够实现核酸绝对定量的精准检测技术，基于泊松分布原理将核酸样品分配到大量独立、平行的微反应单元（纳升级）中，使每个反应室中平均只有一个拷贝或者没有目标dna分子，然后加入荧光信号进行扩增，从而实现靶标核酸分子的绝对计数，提高检测灵敏度和准确度。
4、逆转录pcr（reversetranscription-pcr,rt-pcr）
逆转录pcr也叫反转录pcr，将rna的反转录（rt）和cdna的聚合酶链式扩增相结合，是pcr的一种广泛应用的变形。在rt-pcr中首先经反转录酶将一条单链rna逆转录成cdna，再以cdna为模板，扩增合成目的片段。作为模板的rna可以是总rna、mrna或体外转录的rna产物。无论使用何种rna，关键是确保rna中无rna酶和基因组dna的污染。rt-pcr技术灵敏且应用广泛，可用于检测细胞中基因表达水平，细胞中rna病毒的含量和直接克隆特定基因的cdna序列。一般通过一步法或两步法进行，一步法是rt反应和pcr反应在同一试管中进行；而在两步法中两个反应是分开依次进行的。
5、实时荧光定量逆转录pcr（real-time rt-pcr,rt-qpcr）
real-time rt-pcr是qpcr和rt-pcr的组合，其中的“rt”是reverse transcription（逆转录）的意思，所以rt-qpcr就是结合了荧光定量技术的逆转录pcr，即以mrna或总rna为模板，先反转录得到cdna，再以cdna为模板，通过荧光定量pcr进行定量检测分析。因为rt-pcr只可以定性，但不能进行定量分析。与rt-pcr一样，rt-qpcr定量分析rna也有两种方法：一步法和两步法。两种方法都需要先将rna反转录为cdna，然后再将其作为qpcr扩增的模板，只是一步法中的rt和qpcr在同一试管中进行，两步法中的rt和qpcr是按顺序分开进行。