紫外交联仪的主要用途为在膜上交联核酸，其是一种254mm紫外辐射系统，其有很多用途，uv灭菌消除pcr污染、嘧啶二聚体产生的部分限制性内切酶消化、reca突变筛选以及琼脂糖凝胶中dna的切割等亦是其用途。其的应用价值也体现在聚合物紫外处理和紫外灭菌等方面。以下为紫外交联实验原理和步骤。
原理：和非取代的dna相比较，含有如溴脱氧尿苷胸苷卤代物的dna对于紫外线诱导的交联有着更高的敏感性。
步骤：
1、混合10μl含有高亲和性蛋白结合位点的目的序列的单链m13载体和等摩尔的17 bp m13通用引物，使用1×限制性内切核酸酶缓冲液调节终体积到100μl。在90摄氏度下加热5分钟。在室温下冷却、
2、在杂交混合物中加入klenow 酶 5μl、水7μl、10×限制性内切核酸酶缓冲液7.5μl、0.1 mol/l 二硫苏糖醇1.75μl、50× dntp/brdu 溶液 3.5μl、[α32p] dctp50μ等反应物，在16摄氏度下温浴90分钟。
3、在68摄氏度下加热10分钟，将klenow 酶灭活。
4、使用40u限制性内切核酸酶在合适条件下消化，使得20600 bp的dna片段产生。
5、将乙酸铵添加到0.3 mol/l，dna使用2倍体积的100%乙醇进行沉淀，在te缓冲液中重悬。
6、电泳在含有0.5μg/ml溴化乙锭的琼脂糖凝胶上进行。所要的dna片段使用deae膜进行分离。
7、brdu取代的dna片段的特异活性使用闪烁计数器进行检测，dna的浓度的估计采用溴化乙锭点迹定量法。能够采用迁移率变动dna结合分析法来检测探针的完整性和功能。
8、将下列结合反应建立于1.5 ml圆底小瓶中：将10-20μg dna 载体、经缓冲的含有结合蛋白的提取液以及105cpm均衡标记的探针混合，调节总体积到50μl。瓶口使用塑料薄膜封住，固定再采用parafilm膜加封。
9、在试管架上放上小瓶，于正上方5厘米处使用倒置的紫外透射灯照射1个小时。
10、将1u微球菌核酸酶、dna 酶 i 4μg、0.5 mol/l cacl2 1μl等反应物加入到各结合反应管中，在37摄氏度下消化半个小时。
11、在反应混合物中加入等体积的2×sds样品缓冲液，在100摄氏度中煮沸5分钟。
12、样品的电泳在适当浓度的不连续sds-聚丙烯酰胺凝胶上进行。
13、完成电泳之后，将凝胶前沿的染料切去。
14、干胶，使用增感屏放射自显影13日，来对交联的蛋白质进行观测。