在厌氧生物滤池中，厌氧微生物大部分存在于生物膜中，少部分以厌氧活性污泥的形式存在于滤料的孔隙中，厌氧微生物总量沿池高度分布是很不均匀的，当池的进水部位高时，相应的有机物去除速度也快。当废水中有机物浓度高时，特别是进水悬浮固体浓度和颗粒较大时，进水部位容易发生堵塞现象。为此，对厌氧生物滤池采取如下改进：
（1）出水回来，使进水有机物浓度得以稀释，同时提高池内水流的流速，冲刷滤料孔隙中的悬浮物，有利于消除滤池的堵塞。此外，对某些酸性水，出水回流起到中和作用，减少中和药剂的用量。
（2）部分充填载体。为了避免堵塞，仅在滤池底部和中部各设置一填料薄层，空隙率大大提高，处理能力增大。
（3）采用软性填料，空隙率大，可客服堵塞现象。
厌氧生物滤池有以下特点：
（1）由于填料为微生物附着生长提供了较大的表面积，滤池中的微生物量较高，有因生物膜停留时间长，平均停留时间长达100d左右，因而可承受的有机容积负荷高，cod容积负荷为2kgcod/(m3.d）-16kgcod/(m3.d），且耐冲击负荷能力强，
（2）废水与生物膜两相接触面大，强化了传至过程，因而有机物去除速度快
（3）启动或停止运行后再启动比前述厌氧工艺法时间短。
氮该工艺也存在一些问题，主要是处理含悬浮物浓度高的有机废水时易发生堵塞，尤以进水部位更严重。滤池的清洗也还没有简单有效的方法。