一、开机
连接电源线后，打开机器后部的主开关（在机器的左下角）。开机后机器进行自检“selftest”，自检结束后出现用户主界面，显示加热模块“block”格式和温度“temp”和热盖温度“lid”，在屏幕左上角显示“ready”。
二、程序设置
1.建立新程序
按“file”→“new”→“program”，进入一个编辑窗口输入程序名称按
“enter”键确认，之后进入程序编辑器；在“header”中设置热盖的参数，输入温度和压力，温度默认值为96℃，一般设置为99℃，如变性温度较低时默认值也可以满足使用要求，压力默认值为90n。
按“step”设置pcr循环在“temp”中输入温度后按“enter”，“time”中输入时间按“enter”，依次编辑步骤。输入“goto”要返回的步骤序号，形成pcr循环，输入循环数。2.编辑模板程序
按“file”→“edit”→“program”，进入编辑窗口后按“edit”键开始修改程序，修改完毕后按“save”键保存后关闭该窗口返回主界面。
三、运行程序
程序设置好后，按“run”+“start”，打开一个子窗口选择要运行的程序（后一次修改的程序将自动被选中），确认选择的程序后按“startnow”开始运行程序。
四、暂停与终止
如果要暂停或终止正在运行的程序，按“run”+“pause”或“run”+“stopnow”，暂停后要继续原来的程序按“run”+“continue”。
五、关机
程序运行结束后，界面返回至主菜单。关闭仪器后部的主开关。