对照实验结果好,却没有回收到目的片段,实验出了什么问题?
参考见解:
1 连接用室温保温1小时,能满足大多数克隆,为提高效率,需4oc过夜。
2 插入片段带有污染,使3`-t缺失,或抑制连接,抑制转化。为此,将插入片段和pgem-t正对照混合,再连接。如降低了对照的菌落数,插入片段需纯化,或重新制备。如产生大量的蓝斑,插入片段污染有核酸酶,使pgem-t或pgem-t easy载体3`-t缺失。
3 插入片段不适于连接。用凝胶纯化的插入片段,因受uv过度照射,时有发生。uv过度照射会产生嘧啶二聚体,不利于连接,dna必需重新纯化。
4 带有修复功能的耐热dna聚合酶的扩增产物末端无a,后者是pgem-t或pgem-t easy载体克隆所需。加taq dna聚合酶和核苷酸可在末端加a。详情查pgem-t pgem-t easy载体技术资料(tm042)。
5高度重复序列可能会不稳定,在扩增中产生缺失和重排,如发现插入片段高频率地产生缺失和重排,需用重组缺陷大肠杆菌菌株,如sure细胞。