气相色谱仪色谱柱管材料包括不锈钢材质耐用但是相对活泼的柱表面可能导致被分离组分的损失和峰拖尾。玻璃材质比较脆通常要求对内表面进行脱活处理。熔融石英仅用于毛细管柱，其惰性好坚固耐用是的柱材料。色谱柱特性色谱柱的用途是将多组分的试样样品分成窄的以及分离良好的色谱峰，这两个目标并不是*无关的。
高柱效色谱仪的色谱柱产生窄的色谱峰。柱效是由色谱柱小柱内径的结构和薄的固定相涂层具有的柱效和载气流速决定的。较低的流速接近于色谱柱与载气的优化值。通常色谱柱运行得更快分析也就更迅速，而又不会损失多少柱效。如果分离非常良好或使用更短的色谱柱甚至还可以运行得更快。大多数情况下不要使用低于推荐值的流速，因为其延长分析时间还会降低柱效。