原水由进水口进入机体，流经滤网，滤除水中的细小杂质，随着过滤介质中各种污染物在滤网内侧的累积，过滤通道被堵塞，进出水口压差逐渐增加，当压差达到预设定值时，系统自动启动行程电机和反冲洗高压泵，此时传动装置带动装有吸嘴的排污轴在滤网内侧做旋转和水平往返运动，同时，在滤网外侧，高压反冲洗装置与排污装置同步动作，并呈对应关系，在不中断正常产水的前提下，只借助一小部分产品水，对滤网进行高压反洗，反洗水透过滤网，连同从滤网上剥离的杂质被吸嘴迅速吸入排污轴，后由排污室排出。
一个反洗行程后，压差降低，各部件复位，系统重新进入正常运行状态。
对于难处理的含油、含有机物、粘性物质以及硬度较高的水质，可加装超声波清洗、杀菌、阻垢装置；超声波能够对液体中的微小气泡核产生振动，当声压达到一定值时，气泡将继续膨胀，然后突然闭合，这些小气泡急速崩溃时在气泡内产生了高温（5000k）高压（上千个大气压），并且由于气泡周围的液体高速冲入气泡，而在气泡附近的液体中产生了强烈的局部激波，也形成了局部的高温高压，从而产生了超声的杀菌、清洗、粉碎、乳化、分散、阻垢、促进化学反应等一系列的作用。频率在20khz以上的超声波集氧化、焚烧、超临界氧化等多种水处理技术于一身，不但能防止滤网污堵，延长滤网反洗周期，同时具有显著地杀菌和降解有机物的功能。
含杂质的水由入口进入过滤器，先流经粗滤网①进行粗过滤，然后进入细滤网②内腔进行细过滤，过滤后的净水由出口流出。过滤出来的杂质吸附在细滤网上，并因此形成了滤网内外表面的压差。当压差达到设定值时（比如0.5 bar时），压力传感器传送信号给控制器，控制器打开排污阀④从排污口排出，结果使得水力马达腔和杂质收集器③和⑤室的压力下降，从而产生了类似于真空清洗原理的负压抽吸，滤网表面 的杂质随着反冲洗水通过集污器和水力马达⑦排到污水腔⑥，经过排污孔排出。排水使水力马达和杂物收集器旋转，以使整个滤网得以冲洗。大尺寸的过滤器还带有驱动缸⑧以控制杂质收集器的纵向移动，并防止其移动过快，使整个滤网能被喷嘴冲洗。整个反冲洗过程自动控制，只需数秒，在自清洗过程中不会造成主水流的中断。
主要用于净化水用途，可用于工业、农业、电力、电子、医药、食品、印染、建筑、钢铁、冶金、造纸，煤矿，游泳池，景观，绿化等各行各业的水过滤、水处理、水改造特别是对水质要求较高的微滤领域，全自动过滤器有很多功能可去除水中泥沙、粘土、铁锈、悬浮物、藻类、生物粘泥、腐蚀产物、大分子细菌、有机物及其它微小颗粒等杂质，达到水质净化的目的。