一、工程合同有上诉期限吗
工程合同有上诉期限。上诉期限三年。根据我国法律规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护;有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
二、工程合同无效保证金要退还吗
工程合同无效保证金要退还的。友情提示您，按照相关法律的规定，合同无效或者被撤销后，因该合同取得的财产，应当予以返还，有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失，双方都有过错的，应当各自承担相应的责任。
也就是说，建筑工程合同无效，发包人应该将工程质量保证金退还给承包人，如发包人有过错的，还需要赔偿承包人的损失。
《民法典》第一百五十七条，民事法律行为无效、被撤销或者确定不发生效力后，行为人因该行为取得的财产，应当予以返还;不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方由此所受到的损失;各方都有过错的，应当各自承担相应的责任。法律另有规定的，依照其规定。
三、工程合同纠纷起诉的流程是什么
工程合同纠纷起诉的流程是：
1.提交起诉书，并按对方当事人人数提交相应份数的副本。
2.提交相关证据材料。
3.立案庭在当事人履行必须的手续和交齐有关证据材料之后，在七天内，对符合立案条件的，办理立案手续。
4.当事人收到受理通知书之日起七天内预交案件受理费和其他诉讼费用。
5.法院开庭审理。