合同合法性审查由当事人所在地的人民法院进行审查，一般公司也会有自身的法务部门可以对合同进行审查，或者委托律师事务所进行审查，具体要以法院审查为标准。
一、合同合法性审查由谁来做
合同是否符合法律规定，是否合法，由审判机关人民法院进行审查。合同合法性审查内容：
1.审查合同主体是否合法；
2.审查合同形式是否合法；
3.审查合同内容是否合法应重点审查合同内容是否有损害国家、集体或者第三人的利益;是否有以合法形式掩盖非法目的的情况;是否损害社会公共利益;是否违反法律、行政法规的强制性规定；
4.审查合同订立手续是否合法。
二、合同审查的方法有哪些
1. 合同条款的审查。基本的步骤和方法就是合同条款的审查.全面细致地对合同条款逐一审查,这是审查合同的基本方法.但审查应该有重点。有三方面内容必须审查：一看合同的主体,二看合同的标的,三看合同的数量条款。此三者为合同的必备条款.无此三者则合同不能成立.对于特定合同按照特定合同的特点和要求对其必备条款进行审查,查漏补缺。
2. 文字审查,合同是文字的游戏,使用规范的语言能够避免误会防止争议的发生。
3. 合法性审查.主要审查是否违反法律强制性规定,合同的无效问题。
4. 涉他权利审查.合同标的可能涉及他人知识产权或者其他利益,应该进行审查,避免侵权。
5. 清洁条款审查.清洁条款的审查很重要.在科技发达的当今社会仿制模仿的技术非常高了,清洁条款对于避免纠纷发生很重要。
三、审查合同的主体有哪些
审查合同主体是否合法：
1.对法人资格的审查;
2.对非法人单位资格审查;
3.对外方当事人的资格审查;
4.对公民个人的资格审查;
5.对保证人的资格审查;
6.对代订合同的代理人的资格审查。