赛默飞液质联用仪可以提供多种ms/ms扫描模式。选择反应监测模式（srm）或多反应监测（mrm）具有*的灵敏度和选择性，满足复杂基体样品分析的高要求。子离子扫描（pi）中性丢失扫描（nl）、母离子扫描（pr）及组合扫描模式，在高通量结构鉴定中，可以提高分析灵敏度和信息特异性。同时提供了自动开发ms/ms方法的功能,无须再靠经验来摸索ms/ms的条件。工作站自动捕捉子离子及其优化cid能量，提供的自动裂解曲线可直接用于ms/ms分析。特别适合新从事质谱分析的工作者。
赛默飞液质联用仪的主要特点：
1、灵敏度：
a、采用高频、小口径八极杆，更有效地聚焦离子成束，有助于mrm的高灵敏的采集。
b、采用线性加速的高能碰撞六极杆反应池，有效消除背景噪音和“记忆效应”，从而保证了痕量样品快速、准确的分析结果。
c、赛默飞液质联用仪综合应用上述多种*技术，从而达到了飞克（femtogram）级的检测限；线性范围达到10６。
d、喷射流离子聚焦离子化技术，在提高雾化温度的同时，提高了电场密度，使离子化效率得以显著提升，并有效屏蔽基质干扰；此外，在高速鞘气流的作用下，离子云密度明显增加，进而提高质谱取样效率；这些技术的进步，从离子生成和传输过程提高了质谱检测的灵敏度；同时，该离子源可在0.1~2.5ml/min的流速下操作，使其应用范围进一步扩大。
e、芯片液相色谱技术，安捷伦*的，业内的纳流液相色谱。将纳流分离与电喷雾离子化过程合二为一，*消除管线连接等因素造成的柱外体积扩散；同时，在芯片上可以同时完成样品的富集、纯化和分离，从根本上有效解决了微量样品的进样以及痕量成分的高灵敏分离分析。
f、经惰性处理的镀白金离子传输毛细管，消除电荷蓄积作用，同时保证在极性切换过程中不损失离子；赛默飞的rf离子透镜显著提高高质量端的离子传输；真空系统提高了离子平均自由程，将离子在传输过程中的损耗降低到低；上述技术的综合运用，全面保证了离子传输效率的大化，从而显著提高灵敏度。
2、准确度：自动调谐：配合调谐溶液自动输送系统，软件控制的自动调谐，操作简便，无需其它装置或手工操作，zui大限度提高用户的工作效率。
3、灵活、广泛的应用：赛默飞液质联用仪除了可以配置喷射流离子聚焦离子源和芯片液相色谱，还可以和安捷伦的其它多种离子源配合使用，如：apci,appi等，满足多领域、多用途的需求。