您好,欢迎访问一九零五行业门户网

PCR反应体系主要是什么?

你知道pcr反应体系主要包含那些吗?让我们一起来看看吧!
一、模板(template)
模板即扩增用的dna,可以是任何来源dna(如基因组dna、质粒dna等)或rna(如总rna、mrna、trna、rrna、病毒rna等),但必须符合两个条件:一是纯度必须较高,二是浓度不能太高以免抑制。模板是待扩增的目的基因或特异片段,如诊断病人是否携带有突变基因时,其模板就是提取的病人血液中的dna或rna片段。pcr对模板dna的纯度不要求很高,但应尽量不含有对pcr反应有抑制作用的杂质存在,如蛋白酶、核酸酶、taq dna聚合酶抑制剂、能与dna结合的蛋白质。
二、引物(primers)
人工合成的一对引物可以分别与两条模板dna互补结合的寡核苷酸序列,其中一条称为上游引物,另一条称为下游引物。引物是pcr特异性反应的关键,pcr产物的特异性取决于引物与模板dna互补的程度。理论上,只要知道任何一段模板dna序列,就能按其设计互补的寡核苷酸链做引物,利用pcr就可将模板dna在体外大量扩增。引物浓度一般为0.1~0.5umol/l,浓度过高会引起错配和非特异扩增,浓度过低则得不到产物或产量过低。引物长度一般为15~30bp,引物过长或过短都会降低特异性。其3'末端一定要与模板dna配对,末位碱基最好选用a、c、g(因t错配也能引发链的延伸)。引物gc占45%~55%,碱基应尽量随机分布,避免嘧啶或嘌呤堆积,两引物之间不应有互补链存在,不能与非目的扩增区有同源性。
三、底物(dntp)
dntp包括datp、dttp、dgtp、dctp。dntp溶液呈酸性,使用时应配成高浓度后,以1mol/l naoh或1mol/l tris-hcl的缓冲液将其ph调节至7.0~7.5,小量分装,-20℃冰冻保存。一般存储浓度为10mo/l,各成分以等当量配制,反应终浓度为20~200umol/l,如其中任何一种浓度不同于其他几种时(偏高或偏低),就会引起错配。高浓度可加速反应,但同时增加错误掺入和实验成本;低浓度可提高精确性,而反应速度会降低。dntp的质量与浓度和pcr扩增效率有密切关系,dntp粉呈颗粒状,如保存不当易变性失去生物学活性。多次冻融会使dntp降解。dntp能与mg2+结合,使游离的mg2+浓度降低。当pcr需要较高浓度的dntp时,应在反应体系中适当增加mg2+的浓度。
四、dna聚合酶
pcr所用的酶主要有taq和pfu两种来源,分别来自两种不同的噬热菌。其中,taq扩增效率高但易发生错配:pfu扩增效率弱但有纠错功能。所以,实际使用时必须根据需要做不同的选择。目前使用最多的是taq酶。该酶在92.5℃、95.0℃和97.5℃时,其半衰期分别为130分钟、40分钟和5~6分钟,可见该酶具有良好的热稳定性。taq酶还具有良好的延伸效率,其生物学活性在75~80℃时最高,一般用72℃,每一个酶蛋白分子每秒可延伸约150个核苷酸。在70℃时,延伸速率为60个核苷酸/秒以上。当温度超过80℃时,该酶延伸速率明显下降,可能与引物—模板遭到破坏有关。其最适ph值为8.3~8.5,能催化以dna单链为模板、以碱基互补原则为基础、按5'→3'方向逐个将dntp分子连接到引物的3'端、合成一条与模板dna互补的新的dna子链,无3'→5'的外切酶活性,没有校正功能。某种dntp或mg2+浓度过高,会增加其错配率。用量一般为0.5~5.0个单位/100ul。
五、pcr缓冲液(pcr buffer)
缓冲液的成分最为复杂,除水外一般包括四种有效成分:①缓冲体系,一般使用hepes或mops缓冲体系;②一价阳离子,一般采用钾离子,但在特殊情况下也可使用铵根离子;③二价阳离子,即镁离子,根据反应体系确定,除特殊情况外不需调整;④辅助成分,常见的有dmso、甘油等,主要用来保持酶的活性和帮助dna接触缠绕结构。
更多有关pcr反应体系的主要内容,请联系天津益元利康生物科技有限公司:
其它类似信息

推荐信息