1.细胞系培养初期：保证培养基与微球体处于稳定的ph与温度水平，接种细胞(对数生长期，而非稳定期)至终体积1/3的培养液中，以增加细胞与微载体接触的机会。不同的微载体所用浓度及接种细胞密度是不同的。常使用2-3g/l的微载体含量，更高的微载体浓度需要控制环境或经常换液。
2.贴壁阶段(3-8d)后，缓慢加入培养液至工作体积，并且增加搅拌速度保证*均质混合。
3.培养维持期：进行细胞计数(胞核计数)、葡萄糖测定及细胞形态镜检。随意细胞系增殖，微球变得越来越重，需增加搅拌速率。经过3d左右，培养液开始呈酸性，需换液：停止搅拌，让微珠沉淀5min，弃掉适宜体积的培养液，缓慢加入新鲜培养液(37℃)，重新开始搅拌。
4.收获细胞：首先排干培养液，至少用缓冲液漂洗1遍，然后加入相应的酶，快速搅拌(75-125r/min)20-30min。然后解离收集细胞及其产品。
5.微载体培养的放大：可以通过增加微载体的含量或培养体积进行放大。使用异倍体或原代细胞系培养疫苗、干扰素，已被放大至4000l以上。