谱库检索是质谱仪定性分析为广泛的辅助手段之一。通常gc—ms仪器的数据系统软件都配有不同的质谱数据库和谱库检索程序。通过scan模式（扫描模式）下得到的质谱图经过与谱库对比，得到可信度列表（如下图一），从而推测出相似的物质。
图一
质谱库可分商业谱库和自检谱库
一般新置质谱仪会根据客户需要带有一两个质谱库，这些质谱库可以是质谱厂家构建出来的标准谱库，如农残库，有机溶剂库等，也可以是外界科研机构建立的泛用型质谱库，收集几十万种以上物质的质谱数据。
其中以nist谱库为广泛（national institute of standards and technology，美国标准与技术研究院）。nist每三年更新一次，nist11,nist14,nist17以此类推。05,08版已收录近二十万张质谱库，后续版本谱库记录更多。
此外还有pbm(probabilit)卜basedmatching，概率匹配)检索谱库，即willey质谱数据库，标准谱图已超过27万张，近20万个化合物。saditer库、nisoh库等等谱库就不一一描述.
上述均为通用谱库，另外还有一些质谱库，就如我们提到厂家建立的标准谱库如标准农药库(standardpesticidelmrary)内有340个农药的标准质谱图；药物库(pflegerdruglibrary)内有4370个化合物的标准质谱图，包括许多药物、杀虫剂、环境污染物及其代谢产物和它们的衍生化产物的标准质谱图；以及挥发油库(es—sentialoillibrary)，内有挥发油的标准质谱图。
后用户还可以根据自己的需要将试验中得到的标准质谱图及数据用文本文件保存在用户自建库里，以便加以充分利用。这就是创造出适用于自己科研、检测、质控用的谱库。