杀菌锅是通过较为简单方便的操作来进行有效杀菌的设备，其能够从对设备内部的温度分布以及控温精度进行控制来选择。并且为了能够有效的降低设备在杀菌结束后其的杀菌用水温度出现大幅度的降低，能量产生消耗，所以可以选择双层杀菌锅，这就能够将热水进行储存并重复进行使用。
当需要对内部拥有空气的产品进行杀菌时，又因为其可能会对杀菌之后的外观拥有较为严格的要求，所以能够选择电脑全自动或者是电脑半自动式的杀菌锅来对产品进行杀菌，通过电脑来对杀菌温度进行控制，就不会出现杀菌温度不稳定的情况。
如果需要从能源上进行选择杀菌锅时，可以选择双层式的杀菌锅，这是因为这类的杀菌锅将上罐与下罐进行分离，从而使得能够对上罐中的热水进行循环使用，从而能够有效的节约加热水所需要的能源消耗。
电汽两用型的杀菌锅主要是对于一些产量较小的产品进行杀菌操作的；旋转式杀菌锅能够使得产品不会粘黏在杀菌锅内部，所以主要是对一些拥有较大黏性的产品进行杀菌。