线粒体呼吸链主要由线粒体呼吸链酶组成，线粒体呼吸链复合物i(nadh氧化酶)、线粒体呼吸链复合物ii（琥珀酸脱氢酶）是电子进入线粒体电子传递链（etc）的主要元素。
复合物i催化nadh氧化，复合物ii催化琥珀酸氧化为延胡索酸。随后，辅酶q（q）形成辅酶（qh2），最终导致终端的电子受体o2减少。
线粒体呼吸链复合物iii(细胞s素c氧化还原酶)是线粒体氧化磷酸化的必要蛋白质。线粒体呼吸链复合物iii是线粒体呼吸链的守门人和第三活性氧的主要来源。
线粒体呼吸链复合物iv（细胞s素c氧化酶）是线粒体电子传递链的终端电子受体。复合物iv通过细胞s素c的氧化，将o2转化为水，此过程与线粒体细胞膜atp合成有关。
线粒体呼吸链复合物v与上述四个复合物一起完成氧化磷酸化生成atp，称为atp合成酶，又称f1f0-atp酶。