荧光素发光原理：荧光实际上是一种发光类型，其中光子最初被吸收，导致原子处于激发状态单线态。 当电子回落到基态时，会发射出较低能量的光子。
常用的荧光素特性：
1、异硫氰酸荧光素（fluoresceinisothiocyanate，fitc）为黄色或橙黄色结晶粉，吸收光 490~495nm，发射光 520~530nm，明亮的黄绿色荧光。
2、四乙基罗丹明（rhodamine，rib200）为橘红色粉末，吸收光570nm，发射光 595~600nm，橘红色荧光。
3、四甲基异硫氰酸罗丹明（tetramethylrhodamine-isothiocyanate，tritc）为紫红色粉末，吸收光 550nm，发射光 620nm，橙红色荧光。
4、藻红蛋白（pe），吸收光 490~560nm，发射光 595nm，红色荧光。
5、cy3 (cyanine 3) 是一种发橘黄色荧光的花青素荧光染料，吸收光 550nm，发射光 570nm左右，橘红色荧光。
6、cy5 (cyanine 5) 是一种发远红荧光的花青素荧光染料,吸收光650nm，发射光 690nm左右，红色荧光。