同位素标记 (同位素内标)较于其同种元素的未标物具有质子数相同中子数变化的特点，通过用同位素取代特定原子来标记反应物，然后使反应物进行反应，并检测中子数变化的原子，可通过反应、代谢途径或细胞跟踪同位素。
同位素内标物与对应的未标物理化性质相似，通过光吸收和免疫的方法无法区分，在色谱中如果将同位素内标物与对应的未标物用同样的检测方法，其保留时间也几乎一致，无法分辨。
稳定性同位素内标是质谱方法即稳定性同位素稀释法du有的，在质谱(mass)中，如果加进同位素内标，那测出来的值较未标物有很大的差值，质谱能把同位素内标和要检测的物质区分开。
可供多种稳定同位素标记的内标，包括2h (氘标 d) 、13c、15n、17o、18o、34s等，放射性的同位素内标具有较大的伤害性，一般稳定性同位素可以完成的建议优-选稳定性同位素内标物，若被检测物是稳定同位素内标物对应的未标物，那么，较被检测物而言，对应的同位素标记物只是将部分氢原子(1h)、碳原子(12c)或氮原子(14n)等被2h (氘、d)、13c、15n所取代，被检测物与对应的稳定同位素内标物理化性质基本一致，尤其在色谱中，几乎无法区分。
同样是稳定同位素标记，13c、15n相对来说比2h(氘标) 更好，所以氘标(d、2h)一般也相对而言更便宜，色谱定量中，2h、13c、15n标记的差别不大，如果需要质谱(ms)或者核磁(nmr)定量，一般建议优-选13c或者15n标记。
目前同位素内标广泛应用于检测中：包括维生素检测、胆汁酸检测、激素检测、儿茶酚胺检测等。