裂解气相色谱分析有一定的局限性，主要有：
*，由于受气相色谱分离的特点的限制，从色谱柱流出的只能是热稳定的、分子量有限的化合物，故不易检测到不稳定的中间体和难挥发的裂解产物。这对研究裂解机理是有影响的。py-ms可在一定程度上弥补裂解气相色谱的这一不足，也可用py-hplc以检测分子量大的裂解产物。
第二，裂解产物的定性鉴定比较费时。虽然各种联用仪器分析，如py-gc-ms和py-gc-ftir在这方面有很好的作用，但往往还需要其他辅助定性方法才能得到可靠的鉴定结果，况且对谱图气相色谱实验室来说，购置这些联用仪器来鉴定大量的裂解产物并不是一件容易的事情。
第三，裂解是一个复杂的化学过程，很多因素会影响实验结果，这样，要获得良好的重复性就需要严格控制实验条件，就目前的情况而言，重复性尚能令人满意，但实验室的重现性仍然存在一定问题。所以，实验条件的标准化、数据库的建立和应用是目前py-gc研究的重要课题。
关键词：色谱柱