cyanine5.5 (cy5.5) 是一种常用的荧光染料，广泛应用于生物标记、生物传感器和成像研究等领域。
1. 结构：cyanine5.5的结构与cyanine5类似，都包含一个偶极性的有机骨架，由两个相连的氮杂环组成，中间通过一个五碳链连接。这个骨架的两端通常连接有电子吸引基团，如吲哚环。这种特殊的结构使得cy5.5具有在可见光和近红外区域吸收和发射光的能力。
2. 性质：
- 荧光特性：cy5.5的最大吸收波长大约在675 nm，而最大发射波长则在大约694 nm。这种在近红外区域的荧光性质使得cy5.5在生物成像中特别有用，因为在这个波长区域，生物组织的自身荧光背景较低，光的穿透性较好。
- 化学反应性：cy5.5可以通过其nhs酯、马来酰亚胺或其他活性酯与生物分子（如蛋白质、抗体、核酸等）形成共价键。
- 稳定性：cy5.5具有良好的光稳定性和化学稳定性，可以在长时间的照射下保持其荧光性质。然而，cy5.5对氧和ph敏感，因此需要在无氧和中性ph环境下使用和保存。
- 可溶性：cy5.5在有机溶剂如dmso中可溶，在水或含水溶剂中的溶解度较低。
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