体内20种氨基酸按理化性质可分为4组：
①非极性、疏水性氨基酸：甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、苯丙氨酸和脯氨酸。
②极性、中性氨基酸：色氨酸、丝氨酸、酪氨酸、半胱氨酸、蛋氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺和苏氨酸。
③酸性的氨基酸：天冬氨酸和谷氨酸。
④碱性氨基酸：赖氨酸、精氨酸和组氨酸。
侧链决定了20种α-氨基酸的化学性质，如下表所示：
残基名称三字母
代码单字母
代码相对丰度
（%） e.c.分子量pkavdw体积
（å³）带电（c），
极性（p），
疏水性（h）
丙氨酸（alanine） ala a 13.0 71 67 h
精氨酸（arginine） arg r 5.3 157 12.5 148 c+
天冬酰胺（asparagine） asn n 9.9 114 96 p
天冬氨酸（aspartate） asp d 9.9 114 4.5 91 c-
半胱氨酸（cysteine） cys c 1.8 103 8.3 86 p
谷氨酸（glutamate） glu e 10.8 128 4.5 109 c-
谷氨酰胺（glutamine） gln q 10.8 128 114 p
甘氨酸（glycine） gly g 7.8 57 48
组氨酸（histidine） his h 0.7 137 6.8 118 p,c+
异亮氨酸（isoleucine） ile i 4.4 113 124 h
亮氨酸（leucine） leu l 7.8 113 124 h
赖氨酸（lysine） lys k 7.0 129 11.1 135 c+
甲硫氨酸（methionine） met m 3.8 131 124 h
苯丙氨酸（phenylalanine） phe f 3.3 147 135 h
脯氨酸（proline） pro p 4.6 97 90 h
丝氨酸（serine） ser s 6.0 87 73 p
苏氨酸（threonine） thr t 4.6 101 93 p
色氨酸（tryptophan） trp w 1.0 186 163 p
酪氨酸（tyrosine） tyr y 2.2 163 9.8 141 p
缬氨酸（valine） val v 6.0 99 105 h