变造国家机关公文罪的立案标准是构成犯罪的情形下，会被判处三年以下的有期徒刑，如果情节严重的情况下，是会被判处三年到十年的有期徒刑，并处罚金。
一、变造国家机关公文罪的立案标准
变造国家机关公文罪的立案标准是构成犯罪的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利，并处罚金；情节严重的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
根据《刑法》第二百八十条第一款规定，伪造、变造、买卖或者盗窃、抢夺、毁灭国家机关的公文、证件、印章的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利，并处罚金；情节严重的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
二、变造国家机关公文罪的四要件是哪些
客体是国家机关的正常管理活动和信誉；主体是具有完全刑事责任能力的自然人；客观上实施了变造国家机关公文的行为；主观上是直接故意。
《刑法》第十四条明知自己的行为会发生危害社会的结果，并且希望或者放任这种结果发生，因而构成犯罪的，是故意犯罪。故意犯罪，应当负刑事责任。
三、涉嫌变造国家机关公文罪可以取保候审的情形有哪些
1.可能判处管制、拘役或者独立适用附加刑的；
2.可能判处有期徒刑以上刑罚，采取取保候审不致发生社会危险性的；
3.患有严重疾病、生活不能自理，怀孕或者正在哺乳自己婴儿的妇女，采取取保候审不致发生社会危险性的；
4.羁押期限届满，案件尚未办结，需要继续侦查的。