您好,欢迎访问一九零五行业门户网

PCR引物设计关键事项

pcr引物设计需要注意:
1、引物长度:一般为15~30个碱基,引物太短会降低扩增特异性。引物过长退火温度会提高,不利于反应的发生。
2、引物序列:设计引物时碱基要随机分布,避免碱基或核苷酸的重复导致错误引发;引物间和引物自身序列也要尽量避免互补,防止形成引物二聚体或发夹结构。
3、碱基分布:gc含量一般40-60%,含量过高或过低都不利于进行反应。其含量过低会使引物不稳定;过高会引发非特异性扩增。
4、 tm值:引物的tm值(解链温度)=4(g+c)+2(a+t),尽可能保证上下游引物的tm值一致,一般不超过2℃。
5、 引物设计好后进行blast检查,检测是否与基因组中重复序列或其它基因位点有交叉同源;
6、 引物的特异性:引物的3'端如果含有一个g或c残基能增加引物的特异性。
其它类似信息

推荐信息