液相色谱流动相在选择溶剂时，溶剂的极性是重要的参考依据。例如，采用正相液-液分配分离时首先选择中等极性溶剂，若组分的保留时间太短，降低溶剂极性，反之增加。也可在低极性溶剂中，逐渐增加其中的极性溶剂，使其保留时间缩短。
常用液相色谱流动相溶剂的极性顺序：水（zui大）＞甲酰胺＞乙腈＞甲醇＞乙醇＞丙醇＞丙酮＞二氧六环＞四氢呋喃＞甲乙酮＞正丁醇＞乙酸乙酯＞异丙醚＞二氯甲烷＞氯仿＞溴乙烷＞苯＞二硫化碳＞环己烷＞乙烷＞煤油（zui小）。
有时还需要选用二元或多元溶剂，以灵活调节流动相的极性或增加选择性，以改进分离或调整出峰时间。
根据所起的作用，采用的溶剂可分为底剂和洗脱剂的组合，底剂决定基本的色谱分离情况，洗脱剂则起调节试样组分的滞留，并对某几个组分有选择性的分离作用。因此，流动相中底剂和洗脱剂的组合直接影响分离效率。