遗传中心法则表明，dna是生物体内遗传信息的载体。遗传信息在精密的调控下从dna转录成rna，再传递到蛋白质。因此rna被认为是dna与蛋白质之间生物信息传递的“桥梁”，在研究转录组信息中占有着重大的作用。
背景介绍
转录组（transcriptome）是指在某一特定的生li条件下，细胞、组织或者生物体内所有的转录产物的集合，即转录出来的所有rna总和，包括编码rna（即mrna）和ncrna（trna、rrna、mirna、lncrna、circrna）等不同类型的rna分子。在这之中核糖体rna (rrna) 约占rna总量的 80%，是zui多的一类rna，通常这类rna分子量比较大且代谢不活跃，种类包括：原核生物中5s rrnas、16s rrnas和23s rrnas三种，真核生物中5s rrnas、5.8s rrnas、18s rrnas和28s rrnas四种。
图1：rna分类图
rrna的“作用”
随着人类基因组计划（hgp）和dna元件百科全书计划（encode）的完成，人们发现在人类基因组中大部分dna都可以转录成rna，但是仅有1.5%的核苷酸序列用于蛋白质的编码，剩余不编码蛋白质的的非编码rna（ncrna），被认为是基因组转录噪音。这种转录组噪音（无效信息）基本全部来源于丰度zui高的成员——rrna。
测序的目的就是为了更多的获得生物信息，但是rrna这个在rna中zui丰富的成员却只能提供非常少的转录本的信息，且检测到过多的rrna会掩盖其它基因的表达丰富度；因此，通常在测序之前从rna样品中除去rrna，rrna去除的效率也被视为zui大化读取到转录物的关键因素。
图2：人类组织或细胞总rna中各种rna分布饼状图
rrna的“去除法”
目前rrna去除的方法主要有两种，一种是通过dna探针或者rna探针杂交捕获rrna再用磁珠吸附去除的方法，这种方法称为ribo-zero-seq；另一种是利用双链特异性核酸酶处理的方法提取mrna，称为dsn-seq。两种方法对应的原理与区分如下所示：
方法一（dsn-seq）
去除流程：特异性探针（区分物种）与rrnas杂交——rnase h消化rrnas——dnase i消化探针——其他rna富集纯化
市场占比：在市场现有品牌中占据绝大多数
优势：样本起始量要求低；rrna残留量更低
缺点：其操作较复杂；暂无混合样本效果验证；
流程图：
方法二（ribo-zero-seq）
去除流程：生物素标记探针与rrnas杂交——链霉亲和素磁珠去除探针与rrnas——其他rna富集纯化
市场占比：illumina ribozero与thermo ribominus系列使用该方法
优势：磁珠法，操作简单；可应用于混合样本；
缺点：样本起始量要求高（一般为1 μg）；rrna残留量相对方法1略高；
流程图：
rrna的“高效去除”
hieff ngs® maxup rrna depletion kit (human/mouse/rat)利用rnase h消化法去除人、小鼠、大鼠总rna中的核糖体rna。该试剂盒对于完整和部分降解的总rna（如ffpe rna）均具有良好的rrna去除效果。可用于高通量测序分析mrna和非编码rna，也可用于cdna合成或其它下游应用。
图3：1μg 293t 总rna 进行 rrna 去除，利用 qpcr 对比去除前后 rrna 基因和 mrna 基因的ct值变化（左图）
分别以1μg 人、小鼠、大鼠总rna为样本，试剂盒去除rrna后建库，测序获得rrna残留%数据（右图）