供试品经gc分离为单一组分，按其不同的保留时间，与载气同时流出色谱柱，经过分子分离器接口，除去载气，保留组分进入ms仪离子源被离子化，样品组分转变为离子，经分析检测，记录为ms图。gc-ms中气相色谱仪相当于质谱仪进样系统，而质谱仪则是气相色谱的检测器，通过接口将二者有机地结合。
实验仪器和实验试剂
1、仪器:二手gcms 6890n-5975b（安捷伦质谱）
2、试剂:阳离子红降解产物
二手gcms 6890n-5975b实验步骤
1、开机:二手gcms 6890n-5975b：
①打开氮气源，调节压力为0.5mpa;
②打开电脑并进入软件界面，然后打开gc开关并完成自检，再打开msd开关;
③点击界面上的instrument图标，进入工作站，听到“嘟”声后，开始进行抽真空。
2、方法编辑：
①在instrument窗口栏中，从method菜单中选取edit enter method进入编辑步骤;
②在工作站进行设定参数、进样口温度，进样模式、分流比、温度。
3、数据采集：
①从instrument control中 单击绿色图标，编辑样品名称;
②单击start run开始条件。
4、数据分析：
①点击dataanlysis 目标进入数据处理系统;
②在pile/load data file下找出所需文件;
③将鼠标移至分析色谱峰，双击后测得到质朴图，与结构式导信息。
5、关机：二手gcms 6890n-5975b
①将仪器进样吸柱箱温度降至室温;
②在instrument control 中选取view/diagnestics ;
③在dignostics 中选取vaccunnent进入放空状态;
④放空完成后关闭工作站及电脑，然后关闭gc，后关闭氮气钢瓶。