手性柱是由具有光学活性的单体，固定在硅胶或其它聚合物上制成手性固定相。不同化学性质的异构体不得不采用不同类型的手性柱。手性柱通过引入手性环境使对映异构体间呈现物理特征的差异，从而达到光学异构体拆分的目的。要实现手性识别，手性化合物分子与手性固定相之间至少存在三种相互作用。手性柱的这些相互作用通过影响包埋复合物的形成，特殊位点与分析物的键合等而改变手性分离结果。
在手性拆分中，温度的影响是很显著的。低温增加手性识别能力，但可能引起色谱峰变宽而导致分离变差。因此确定手性分析方法过程中要考虑柱温的影响，确定*优柱温，以达到好的分离效果。如果使用手性柱中异构体的分离度下降该怎么办？
分离度下降的原因有可能是色谱柱以外的色谱条件发生了变化，或者色谱柱受损柱效发生了变化。首先查看是否是因为温度、流动相成分等外在因素发生了变化导致分离度下降，如果排除了各种外在因素就有可能是分析柱本身的柱效下降导致的。如果分离度在短时间内急剧下降伴随柱压上升，可能是有强极性溶剂损害了柱子；如果分离度在长时间内慢慢下降，可能是柱头受污染或柱头塌陷，需要更换保护柱或者更换分析柱。