利用本实验室cdna文库测序所获得的茶树est序列为主自行开发的24对和他人7对共31对est-ssr引物，对60份西南茶区茶树资源进行了遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明，西南茶区茶树资源的遗传多样性非常丰富。31对引物共检测到等位位点137个，每个引物为2～8个之间，平均4．42个。遗传多态性信息含量（pic）在0．09-0．85之间，平均达0．63。观测杂合度（ho）在0．07-0．94之间，平均值为0．53。upgma聚类表明，按相似系数为0．39可将参试的60份种质资源分为五大类。聚类结果在分子水平上显示了我国西南茶区种质资源间的亲缘关系，为以后种质资源保存和新品种选育提供一定的启示。完成机构：[1]中国农业科学院茶叶研究所茶树资源与改良研究中心,国家茶树改良中心,杭州310008 [2]云南省农业科学院茶叶研究所,勐海666201