用人单位赔偿劳动者双倍工资是根据用工时间累计算的；根据我国法律规定，双倍工资的仲裁时效是一年，自当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起开始起算。
一、用人单位赔偿劳动者双倍工资是怎么算的
用人单位赔偿劳动者双倍工资的计算如下：
1.用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。
2.用人单位与劳动者订立无固定期限劳动合同的，自应当订立无固定期限劳动合同之日起向劳动者每月支付二倍的工资。
二、双倍工资的仲裁时效
双倍工资的仲裁时效是一年。
劳动者申请用人单位支付双倍工资的劳动争议案件，申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。劳动争议仲裁委员会收到仲裁申请之日起五日内，认为符合受理条件的，应当受理，并通知申请人。
《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条， 劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
前款规定的仲裁时效，因当事人一方向对方当事人主张权利，或者向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务而中断。
三、双倍工资的差额
用人单位逾期未签劳动合同，双倍工资的差额从单位用工的第二个月计算到劳动者在单位的实际工作年限为止，但最多计算不超过十一个月的双倍工资，且单位已经支付的工资要扣除。
通常赔偿双倍工资的时候，还可以主张经济补偿金、加班费及补偿金、社会保险。
双倍工资的赔偿时按照实发工资，实发工资包括提成奖金等等，不能拿最低工资来参考。中国很多地方的仲裁机构，往往在仲裁裁决的时候，错误地拿最低工资来参考，这是错误的，有的劳动部门变相维护企业的利益，所以在到法院起诉的时候被纠正过来。