首先要安装mysql驱动程序包，详细步骤如下：
step 1:将mysql-connector-java-5.1.7-bin.jar文件拷贝到....../matlab/r2009a/java/jar/toolbox
step 2:到....../matlab/r2009a/toolbox/local目录下，找到classpath.txt文件，打开，并添加用来加载mysql的jdbc驱动语句：
$matlabroot/java/jar/toolbox/mysql-connector-java-5.1.7-bin.jar
step 3:重新打开matlab即可
驱动程序安装成功后，接来下要是matlab连接mysql数据库的代码：
conn=database('databasename','username','password','driver','databaseurl')
连接成功后，返回连接对象。
参数如下：*databasename: 数据库名称.
*driver: jdbc driver.
*username and password: 用户名和密码.
*databaseurl: 类似于jdbc:subprotocol:subname. subprotocol是数据库类型,
subname类似于//hostname:port/databasename.
如果matlab和数据库建立了连接，将返回类似于如下信息：
instance: 'sampledb'
username: ''driver: []url: []constructor: [1x1com.mathworks.toolbox.database.databaseconnect]
message: []handle: [1x1 sun.jdbc.odbc.jdbcodbcconnection]
timeout: 0autocommit: 'off'
type: 'database object'
连接mysql的代码如下：
conn = database('tissueppi','root','root','com.mysql.jdbc.driver','jdbc:mysql://localhost:3306/tissueppi');
连接成功后，就可以用exec函数执行sql语句
exec函数执行sql语句并返回一个开指针
语法如下：curs =exec(conn,'sqlquery')
例如：curs = exec(conn, 'select * fromcustomers')
执行完查询后，还要将查询结果从开放cursor对象导入到对象curs中，该功能是用
cursor.fetch函数实现的。
语法如下：curs =fetch(curs)
使用curs.data来显示数据，curs.data返回一个cell结构，可以先把cell结构转换成
matrix结构再取值：
cur=cell2mat(cur)
a=cur(1,1);则查询结果就加到了向量a中
注意：在exec函数执行查询过程中，有的sql语句要输入变量，这时可使用strcat函数完成该
功能。t =strcat(s1, s2, s3, ...)
for(t=1:10)sql1 = strcat('select count(did) from rss_genepairs_u wheregocc>=',num2str(t),' || gomf>= ',num2str(t),' || gobp >=',num2str(t));
end
完整代码如下：conn =database('tissueppi','root','root','com.mysql.jdbc.driver','jdbc:mysql://localhost:3306/tissueppi');
for t=0.5:0.01:0.91
for x=0.5:0.1:11
sql = strcat('select count(did) from rss_genepairs_x2 where score=',num2str(t),' || gomf>= ',num2str(t),' || gobp >=',num2str(t),')');
atemp = exec(conn,sql);
atemp = fetch(atemp);
a = atemp.data;
a = cell2mat(a);
a= a(1,1);endend