气相色谱仪是利用混合物在液仪和固体或不互溶的两种液体之间分配比的差异，从而对混合物进行分离，然后分析鉴定的仪器。设备机身由储液器、泵、进样器、色谱柱、检测器、记录仪等部分组成，其使用方法也需要操作者提前熟知。
1、打开氮气、氢气、空气发生器的电源开关，调整输出压力稳定在0. 4kpa左右。
2、打开色谱仪气体净化器的氮气开关转到“开”的位置。
3、注意观察色谱仪载气日的柱前压上升并稳定大约5分钟后，打开色谱仪的电源开关。
4、设置柱箱、进样器和检测器等各工作部温度。
5、待检测器温度升到150个以上后，打开净化器上的氢气、空气开关阀到“开”的位置。
6、观察色谱仪上的氢气和空气压力表分别稳定在0. 1npa和0.15mpa左右。
7、按住点火开关(每次点火时间不能超过6~8秒钟)点火。同时用明壳的金属片靠近检测器出口，当火点着时在金属片上会看到有明显的水汽。如果在6~8秒时间内氢气没有被点燃，要松开点火开关重新点火。
8、在点火操作的过程中，如果发现检测器出口内白色的聚四氯帽中有水凝结，可旋下检测器收集极帽，将水清理掉。
9、在色谱工作站上判断氢火焰是否点燃的方法：观察基线在氢火焰点端后的电压值应高于点火之前。
10、打开电脑及工作站的方法文件：脂肪酸分析方法或碘分析方法。显示屏左下方应有蓝字显示当前的电压值和时间。接着转动色谱仪放大器面板上点火按钮上的“粗调”旋钮，检查信号是否为通路。待基线稳定后进样品并同时点击“启动”按钮进行色谱数据分析。
11、分析结束后，点击“停止”按钮，数据即自动保存。
12、苜先关闭氢气和空气气源，使氢火焰检测器灭火。在氢火焰熄灭后再将柱箱的初始温度、检测器温度及进样器温度设置为室温，待温度降至设置温度后，关闭色谱仪电源及氨气。