功能指令又称专用指令，cpm1a系列plc提供的功能指令主要用来实现程序控制，数据处理和算术运算等。这类指令在简易编程器上一般没有对应的指令键，只是为每个指令规定了一个功能代码，用两位数字表示。在输入这类指令时先按下“fun”键，再按下相应的代码。下面将介绍部分常用的功能指令。
1．空操作指令nop（0 0）
本指令不作任何的逻辑操作，故称空操作，也不使用继电器，无须操作数。该指令应用在程序中留出一个地址，以便调试程序时插入指令，还可用于微调扫描时间。
2．结束指令end（01）
本指令单独使用，无须操作数，是程序的最后一条指令，表示程序到此结束。plc在执行用户程序时，当执行到end指令时就停止执行程序阶段，转入执行输出刷新阶段。如果程序中遗漏end指令，编程器执行时则会显示出错信号：“no end inset”：当加上end指令后，plc才能正常运行。本指令也可用来分段调试程序。
3．互锁指令il（02）和互锁清除指令ilc（0 3）
这两条指令不带操作数，il指令为互锁条件，形成分支电路，即新母线以便与ld指令连用，表示互锁程序段的开始；ilc指令表示互锁程序段结束。
互锁指令il和互锁清除指令ilc用来在梯形图的分支处形成新的母线，使某一部分梯形图受到某些条件的控制。il和ilc指令应当成对配合使用，否则出错。il/ilc指令的功能是：如果控制il的条件成立（即on），则执行互锁指令。若控制il的条件不成立（即off），则il与ilc之间的互锁程序段不执行，即位于il/ilc之间的所有继电器均为off，此时所有定时器将复位，但所有的计数器，移位寄存器及保持继电器均保持当前值。
4．跳转开始指令jmp（0 4）和跳转结束指令jme（0 5）
这两条指令不带操作数，jmp指令表示程序转移的开始，jme指令表示程序转移的结束。
jmp/jme指令组用于控制程序分支。当jmp条件为off时，程序转去执行jme后面的第一条指令；当jmp的条件为on，则整个梯形图按顺序执行，如同jmp/jme指令不存在一样。
在使用jmp/jme指令时要注意，若jmp的条件为off，则jmp/jme之间的继电器状态为：输出继电器保持目前状态；定时器/计数器及移位寄存器均保持当前值。另外jmp/jme指令应配对使用，否则plc显示出错。
5．逐位移位指令 sft（10）
又称移位寄存器指令，本指令带两个操作数，以通道为单位，第一个操作数为首通道号d1，第二个操作数为末通道号d2。所使用的继电器有：000ch~019ch, 200ch~252ch, hr00~hr19。其功能相当于一个串行输入移位寄存器。
移位寄存器有数据输入端（in）、移位时钟端（cp）及复位端（r），必须按照输入（in）、时钟（cp）、复位（r）和sft指令的顺序进行编程。当移位时钟由off→on时，将（d1~d2）通道的内容，按照从低位到高位的顺序移动一位，最高位溢出丢失，最低位由输入数据填充。当复位端输入on时，参与移位的所有通道数据均复位，即都为off。
如果需要多于16位的数据进行移位，可以将几个通道级连起来。
移位指令在使用时须注意：起始通道和结束通道，必须在同一种继电器中且起始通道号≤结束通道号。
6．锁存指令keep（11）
本指令使用的操作数有：01000~01915、20000~25515、hr0000~hr1915，其功能相当于锁存器，当置位端（s端）条件为on时，keep继电器一直保持on状态，即使s端条件变为off，keep继电器也还保持on，，直到复位端（r端）条件为on时，才使之变off ，keep 指令主要用于线圈的保持，即继电器的自锁电路可用keep指令实现。若set端和res端同时为on，则keep继电器优先变为off。锁存继电器指令编写必须按置位行（s端），复位行（r端）和keep继电器的顺序来编写。
7．前沿微分脉冲指令difu（13）和后沿微分脉冲指令difd（14）
本指令使用操作数有：01000~01915、20000~25515、hr0000~hr1915，difu的功能是在输入脉冲的前（上升）沿使指定的继电器接通一个扫描周期之后释放，而difd的功能是在输入脉冲的后（下降）沿使指定的继电器接通一个扫描周期之后释放。