酶标仪用于检测钙离子通路主要通过两种方式：1，荧光法。化合物与细胞膜上离子通道结合后，改变离子通道状态，通道打开，钙离子进入细胞。进入细胞后与细胞内钙离子荧光指示剂结合，发出荧光后酶标仪捕获，荧光强度与进入细胞的钙离子含量成正比。荧光指示剂多用fluo3，fluo3-am是一种可以乙酰甲酯衍生物，可以穿透细胞膜进入细胞，进入细胞后被细胞内的酯酶剪切成fluo3并滞留在细胞内，钙离子进入细胞后与之结合，会发出较强的荧光。
2，发光法。水母发光蛋白复合物（aequorin）由22kda的水母蛋白（apoaequorin protein）、分子氧和底物腔肠素组成。只有当钙离子（ca2+）与该复合物结合后，腔肠素才能被氧化生成高能量产物coelenteramide，同时释放出co2和蓝色荧光（——466 nm）。正是此ca2+依赖性的反应过程（见图1），使得腔肠素非常适用于监测活细胞内钙离子水平。与常规的荧光钙离子指示剂相比，其主要具有以下几个优点，1）能检测较大范围的钙浓度 – 从0.1 μm至 >100μm；2）样品无自体荧光，背景荧光低于使用荧光钙离子指示剂；虽然信号比使用荧光钙离子指示剂弱，但是通过成像仪器可以得到更高的信噪比，因此具有更高的灵敏度。3）水母发光蛋白复合体能够稳定维持在细胞内，使其能够进行数小时至数天的钙离子监测。